
PMseq Datician病原專家分析系統(tǒng)是華大基因(300676)自主開發(fā)的智能集成化本地生信分析服務器,可與PMseq 病原高通量測序實驗過程自動偶聯(lián),一鍵智能生成檢測報告,無需專業(yè)的生信分析人員,保證了數據安全和結果準確。
基于PMseq Datician病原專家分析系統(tǒng)的PM Display、PM Online組件,可輕松實現(xiàn)線上數據管理分析、報告智能生成功能,讓PMseq 組學大數據分析簡單易用!
PM Display智能報告系統(tǒng)
PM Display智能報告系統(tǒng)是配套PMseq 病原微生物高通量測序產品的組學大數據分析系統(tǒng),實現(xiàn)對PMseq 病原檢測后的檢測結果歸集、存儲、統(tǒng)計、分析、數據挖掘。使用可視化操作界面,人工確定檢出病原為最終臨床報告。該系統(tǒng)帶自我學習功能,在使用過程中不斷結合用戶給出的結果優(yōu)化默認推薦病原,并能結合PM Online給出不同病原的檢出分布。
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PM Online線上數據管理系統(tǒng)
PM Online線上數據管理系統(tǒng)集成了PMseq 自動化病原分析數據平臺,使得病原鑒定組學數據在中心本地化集中存儲,實現(xiàn)用戶在線授權訪問,可以協(xié)助醫(yī)院實現(xiàn)病原組學檢測數據管理、病原統(tǒng)計、檢出頻率、病原譜和時空分布等統(tǒng)計分析功能;并且支持數據共享合作,臨床和基因組學科學研究,可為醫(yī)院及疾控等機構的大數據分析與再挖掘提供強有力的技術平臺支撐。

升級亮點
數據定時交互
PM Display與PM Online進行數據定時交互,實現(xiàn)報告解讀到數據收集統(tǒng)計的一體化和自動化。

更完善!更全面!更科學!
PMseq 報告配置不斷更新升級,使其更完善!更全面!更科學!配置PMseq 默認報告模板以及個性化報告模板;上線“檢出疑似耐藥基因列表”和“檢出疑似毒力基因列表”;升級“參考文獻”和“微生物說明”數據庫!


報告節(jié)選
數據更豐富
新增“樣本類型特異性的病原微生物檢出率”,輔助解讀人員對出列微生物更好地判讀。
助力城市Q熱疫情流行監(jiān)控
2021年7月,中山大學附屬第五醫(yī)院聯(lián)合華大基因研究團隊,在國際期刊《PLoS Negl Trop Dis》(IF=4.4) 上發(fā)表一篇科學論文,闡述了2018年底至2019年初,研究者利用宏基因組測序技術 (mNGS) 在珠海監(jiān)控到了城市Q熱疫情流行[1]。
研究者對疑似感染的未知病原發(fā)熱查因患者進行PMseq 檢測,監(jiān)測到中大五院2018年4月份開始檢測到貝納特柯克斯體,確診Q熱病例,并在接下來的十幾個月中持續(xù)檢測到該病原體,且在2018年底和2019年初達到了檢出率的高峰。
研究者在該病原體檢出最高峰時期采集了珠海市唯一屠宰場的牛、羊血液,同樣用PMseq 檢測到了較高比例的貝納特柯克斯體陽性樣本。然后,研究者利用該批病人的手機定位數據,結合牛、羊樣本檢測結果,推測了一起可能由動物傳染、聚集傳播的城市Q熱流行事件[1]。

病原體mNGS檢測已經全新開啟醫(yī)院本地化建設的新篇章。基于PMseq Datician病原專家分析系統(tǒng)的PM Display、PM Online組件升級,助力數據管理及報告解讀更智能,讓病原宏基因組測序數據簡單易用!華大基因將不懈努力提升產品質量,為臨床精準診療提供更全面的解決方案,讓更多百姓受益于基因科技。


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